Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL68

PROSER3, Proline and serine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROSER3Q2NL68 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms