Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q1T7F1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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