Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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