Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
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