Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms