Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms