Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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