Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SPEGQ15772 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPEGQ15772 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms