Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SF1Q15637 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SF1Q15637 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SF1Q15637 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SF1Q15637 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SF1Q15637 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SF1Q15637 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SF1Q15637 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SF1Q15637 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SF1Q15637 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SF1Q15637 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SF1Q15637 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SF1Q15637 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SF1Q15637 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SF1Q15637 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SF1Q15637 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SF1Q15637 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SF1Q15637 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SF1Q15637 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SF1Q15637 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SF1Q15637 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SF1Q15637 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SF1Q15637 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SF1Q15637 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SF1Q15637 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SF1Q15637 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SF1Q15637 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SF1Q15637 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SF1Q15637 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SF1Q15637 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SF1Q15637 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SF1Q15637 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SF1Q15637 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SF1Q15637 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SF1Q15637 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SF1Q15637 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SF1Q15637 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SF1Q15637 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SF1Q15637 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SF1Q15637 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SF1Q15637 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SF1Q15637 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SF1Q15637 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SF1Q15637 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SF1Q15637 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SF1Q15637 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SF1Q15637 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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