Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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