Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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