Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
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