Protein–RNA interactions for Protein: Q15119

PDK2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK2Q15119 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK2Q15119 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms