Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CDK5R1Q15078 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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