Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
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