Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms