Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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