Protein–RNA interactions for Protein: Q14525

KRT33B, Keratin, type I cuticular Ha3-II, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33BQ14525 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT33BQ14525 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms