Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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CKAP5Q14008 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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CKAP5Q14008 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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