Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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