Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA7Q13683 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms