Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
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