Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
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