Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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