Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD2Q13563 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
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