Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

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Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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PTPRSQ13332 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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PTPRSQ13332 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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PTPRSQ13332 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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PTPRSQ13332 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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PTPRSQ13332 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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PTPRSQ13332 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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PTPRSQ13332 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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PTPRSQ13332 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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PTPRSQ13332 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRSQ13332 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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