Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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