Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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