Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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