Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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