Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRDM2Q13029 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
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