Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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PTP4A2Q12974 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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PTP4A2Q12974 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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PTP4A2Q12974 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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