Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms