Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms