Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms