Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms