Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms