Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms