Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms