Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1T1Q06455 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms