Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms