Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OC90Q02509 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OC90Q02509 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OC90Q02509 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OC90Q02509 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OC90Q02509 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OC90Q02509 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OC90Q02509 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OC90Q02509 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OC90Q02509 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OC90Q02509 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OC90Q02509 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OC90Q02509 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OC90Q02509 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
OC90Q02509 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OC90Q02509 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms