Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSG4Q00888 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms