Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDC42EP1Q00587 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms