Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms