Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKOR1P84550 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms