Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms