Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms