Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP107P57740 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP107P57740 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms