Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN17P56750 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms